En el vertedero de San Marcos existen zonas habilitadas para recibir los residuos previamente seleccionados por los usuarios. Su principal finalidad es la de recuperar los materiales o componentes potencialmente reciclables presentes en los residuos depositados. Estas zonas se conocen como Depósitos Alternativos de Residuos y consisten en instalaciones donde se han dispuesto contenedores en los que se pueden depositar los residuos previamente seleccionados que se agrupan en seis categorías: